MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	TCT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022354	T	7	7	568	574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022354	T	6	6	601	606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022354	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022354	T	6	6	1466	1471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022354	TA	3	6	1489	1494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022354	TAA	2	6	1506	1511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022354	TAA	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022354	T	6	6	2919	2924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022354	A	6	6	2950	2955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022354	GA	4	8	2985	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022354	A	6	6	3062	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022354	TAT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022354	A	6	6	3127	3132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022354	T	6	6	3218	3223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022354	T	9	9	3229	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022354	CTC	2	6	3253	3258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_022354	TA	4	8	3277	3284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022354	TA	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022354	ATT	2	6	3295	3300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022354	ATTAAA	2	12	3302	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022354	ATTA	2	8	3318	3325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022354	AT	4	8	3326	3333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022354	TTA	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022354	TTA	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022354	TAG	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022354	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022354	A	7	7	3464	3470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022354	ATT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022354	AATC	2	8	3503	3510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022354	T	6	6	3511	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022354	AT	3	6	3537	3542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022354	A	8	8	3558	3565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022354	TTA	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022354	T	6	6	3663	3668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022354	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022354	T	6	6	3709	3714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022354	AAAT	2	8	3737	3744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022354	T	6	6	3786	3791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022354	TAT	3	9	3920	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022354	TA	3	6	3967	3972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022354	CAT	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022354	T	7	7	4013	4019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022354	AT	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022354	T	7	7	4039	4045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022354	CTG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022354	TCC	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_022354	AGCT	2	8	4762	4769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_022354	TAT	2	6	5781	5786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022354	TTCC	2	8	5787	5794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022354	A	6	6	7793	7798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022354	TA	3	6	7826	7831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022354	T	7	7	7842	7848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022354	TCAT	2	8	7886	7893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022354	TTC	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022354	CTTTC	2	10	8062	8071	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022354	ACCC	2	8	8175	8182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_022354	T	8	8	8191	8198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022354	GAT	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022354	TGA	2	6	8300	8305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022354	AATC	2	8	8331	8338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_022354	TCCT	2	8	8389	8396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022354	TTA	2	6	8401	8406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022354	TCA	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022354	A	6	6	10452	10457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022354	A	6	6	10582	10587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022354	TTTA	2	8	10651	10658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022354	TTA	2	6	10678	10683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022354	ATC	2	6	10785	10790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022354	AAT	2	6	10803	10808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022354	TTC	2	6	10840	10845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022354	A	6	6	10860	10865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022354	AGT	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022354	TTTG	2	8	10951	10958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022354	CCT	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_022354	A	6	6	12421	12426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022354	ATT	2	6	12467	12472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022354	TATTAA	2	12	12473	12484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022354	AAAT	2	8	12488	12495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022354	TTA	2	6	12502	12507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022354	TAA	2	6	15393	15398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022354	ATA	3	9	15399	15407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022354	TTTA	2	8	23657	23664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022354	TGAT	2	8	23676	23683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022354	ATCC	2	8	23688	23695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022354	A	6	6	23708	23713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022354	TCA	2	6	23715	23720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022354	A	6	6	23753	23758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022354	TAA	2	6	23771	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022354	TTG	2	6	26503	26508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022354	ACC	2	6	30620	30625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_022354	TAA	2	6	30650	30655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022354	AAT	2	6	30666	30671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022354	A	7	7	30698	30704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022354	TAT	2	6	30726	30731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022354	A	7	7	30737	30743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022354	TAATT	2	10	30744	30753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022354	TTTGT	2	10	30754	30763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022354	ATT	2	6	30776	30781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022354	TTTA	2	8	30790	30797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022354	T	6	6	30809	30814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022354	TTA	2	6	30823	30828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022354	T	6	6	32186	32191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022354	A	6	6	32207	32212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022354	TAA	2	6	32218	32223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022354	A	6	6	32250	32255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022354	TA	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022354	TA	3	6	32298	32303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022354	GTT	2	6	34143	34148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022354	T	6	6	34210	34215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022354	CTT	2	6	34281	34286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022354	A	6	6	34542	34547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022354	AAAT	2	8	34589	34596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022354	GCA	2	6	34627	34632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022354	T	6	6	34642	34647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022354	CAA	2	6	34691	34696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022354	CTC	2	6	34710	34715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_022354	A	7	7	34816	34822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022354	TTA	2	6	34861	34866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022354	AAAATT	2	12	34896	34907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022354	TTTTA	2	10	34915	34924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022354	A	6	6	34924	34929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022354	ATAGAA	2	12	34952	34963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022354	ATT	2	6	35026	35031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022354	T	6	6	35106	35111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022354	T	6	6	35115	35120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022354	TTTC	2	8	35163	35170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022354	T	6	6	35178	35183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022354	TAA	2	6	35268	35273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022354	AAGAG	2	10	35274	35283	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022354	TAA	2	6	35331	35336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022354	T	6	6	35337	35342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022354	T	7	7	35350	35356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022354	T	7	7	35674	35680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022354	TAT	2	6	35707	35712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022354	TAA	2	6	35717	35722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022354	TA	3	6	35723	35728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022354	A	6	6	35728	35733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022354	TA	3	6	35740	35745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022354	TTAT	2	8	35746	35753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022354	AT	3	6	35752	35757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022354	TAT	2	6	37980	37985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022354	AGT	2	6	37991	37996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022354	TAA	2	6	38016	38021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022354	AAT	2	6	38043	38048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022354	A	6	6	38096	38101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022354	TA	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022354	TTA	2	6	41565	41570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022354	GTC	2	6	41588	41593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022354	ATG	2	6	41605	41610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022354	ATG	2	6	41635	41640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022354	ATC	2	6	46559	46564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_022354	ATT	2	6	46565	46570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022354	ATA	2	6	46608	46613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022354	TAA	2	6	46684	46689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022354	TGA	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022354	ATTT	2	8	46762	46769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022354	TCTTGT	2	12	46776	46787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_022354	GTAGC	2	10	46791	46800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_022354	T	7	7	46845	46851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022354	ATCT	2	8	46855	46862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_022354	TAGA	2	8	46874	46881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022354	TCA	2	6	46884	46889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.